Excursus in Homerum. Oxoniae, E Typographeo Clarendoniano, 1822. [7]
Exulum reditus in patriam ex Graecis Romanisque historiis enotati [8]
Editiones Criticae[]
P. Virgilii Maronis Opera: varietate lectionis et perpetua adnotatione illustrata. Lipsiae, Sumtibus Caspari Fritsch, 1787-1789.
P. Virgilii Maronis Opera in Tironum Gratiam Perpetua Annotatione novis curis illustrata. Lipsiae, Sumtibus Caspari Fritsch, 1800.
P. Virgilius Maro qualem omni parte illustratum tertio publicavit Chr. Gottlob Heyne, cui Servium pariter et Cerdam et variorum Notas cum suis subiunxit N.E. Lemaire. Parisiis, colligebat N.E. Lemaire, 1819-22.
Homeri Carmina cvm brevi annotatione: accedvnt variae lectiones et observationes vetervm grammaticorvm cvm nostrae aetatis critica. Lipsiae, in libraria Weidmannia, 1802.
Homeri Ilias cum brevi Annotatione curante C.G. Heyne. Lipsiae, Libraria Weidmannia, 1804.
Pindari carmina: cum lectionis varietate et adnotationibus. Gottingae, typis Jo. Christian. Dieterich., 1817.
Diodori Siculi Bibliothecae historicae libri qui supersunt e recensione Petri Wesselingii cum interpretatione latina Laur. Rhodomani atque annotationibus variorum integris indicibusque locupletissimis nova editio cum commentationibus III Chr. Gottl. Heyniiet cum argumentis disputationibusque Ier. Nic. Eyringii. Argentorati, e typographia Societatis Bipontinae, 1798.
Commentaria[]
1770-1779[]
Super veterum ebore eburneisque signis. Commentatio prior (1770) [9]
Super veterum ebore eburneisque signis. Commentatio posterior (1770) [10]
De Castoris epochis populorum ΘΑΛΑΤΤΟΚΡΑΤΗΣΑΝΤΩΝ, h. e. qui imperium maris tenuisse dicuntur (1770) [11]
De fabularum religionumque Graecarum ab Etrusca arte frequentatarum naturis et caussis commentatio (1772) [12]
De Castoris epochis populorum ΘΑΛΑΤΤΟΚΡΑΤΗΣΑΝΤΩΝ, h. e. qui imperium maris tenuisse dicuntur, Commentatio posterior (1772) [13]
Monumentorum Etruscae artis ad genera sua et tempora revocatorum illustratio. Et nunc quidem Specimen I. antiquiorum (1773) [14]
Monumentorum etruscae artis ad genera sua et tempora revocatorum illustratio. Specimen alterum id que recentiorum (1774) [15]
Commentatio de vestigiis domesticae religionis patriique ritus in artis Etruscae operibus (1775) [16]
Etrusca antiquitas a commentitiis interpretamentis liberata (1776) [17]
De origine et caussis fabularum Homericarum (1777) [18]
De maribus inter Scythas morbo effeminatis et de hermaphroditis Floridae (1778) [19]
De Theogonia ab Hesiodo condita. Ad Herodoti lib. II. c. 52 (1779) [20]
1780-1789[]
De Hercule Musageta nominisque caussis (1780) [21]
Emendata et addenda ad spicilegium antiquitatis mumiarum in III. vol. commentat. (1781) [23]
De numo Juniae Fadillae Augustae et de numo Othonis aereo Graeco e Museo illmae. Comitis de Bentinck (1781) [24]
Mumiae, quae ex Regis Daniae liberalitate in Museo academico servatur, accuratior notitia cum observationibus (1781) [25]
Nova armorum inventa in vetere Graecia quid ad rerum summam profecerint (1782) [26]
De Diodori fide et auctoritate aestimanda ex auctoribus quos sequitur (1782) [27]
De acie Homerica et de oppugnatione castrorum a Troianis facta (1783-84) [28]
De fontibus et auctoribus historiarum Diodori et de eius auctoritate et auctorum quos sequitur fide aestimanda. Commetatio II. ad libros II-V (1784-85) [29]
De fontibus et auctoribus historiarum Diodori. Commentatio tertia et postrema ad libros XI-XL (1784-85) [30]
De auctoribus formarum quibus dii in priscae artis operibus efficti sunt (1785-86) [31]
Religionum et sacrorum cum furore peractorum origines et caussae ad loc. Strabonis de curetibus lib. X. (1785-86) [32]
Temporum mythicorum memoria a corruptelis nonnullis vindicata (1785-86) [33]
De Graecorum origine e septentrionali plaga repetenda suspiciones (1785-86) [34]
Antiquitatis Byzantinae recognitio historica et critica (1788-89) [39]
Monumentorum et operum artis antiquae Byzantii ante novam romam conditam recensus (1788-89) [40]
De usu sermonis Romani in administrandis provinciis a Romanis probato (1788-89) [41]
Vasorum fictilium litteratorum et ectyporum genus superstes, necdum satis exploratae fidei, ad examen vocatum (1788-89) [42]
Priscae artis opera ex epigrammatibus graecis partim eruta partim illustrata; nunc quidem antiquiorum operum memorabilia. Commentatio I. (1789-90) [43]
Priscae artis opera ex epigrammatibus graecis partim eruta partim illustrata; nunc quidem antiquiorum operum memorabilia. Commentatio II. (1789-90) [44]
1790-1799[]
Priscae artis opera, quae Constantinopoli extitisse memorantur. Sectio I. (1791-92) [45]
Priscae artis opera, quae Constantinopoli extitisse memorantur. Sectio II. (1791-92) [46]
Serioris artis opera quae sub Imperatoribus Byzantinis facta memorantur. Sectio I. (1791-92) [47]
Serioris artis opera quae sub Imperatoribus Byzantinis facta memorantur. Sectio II. (1791-92) [48]
De interitu operum cum antiquae tum serioris artis quae Constantinopoli fuisse memorantur eiusque caussis ac temporibus. Commentatio prior (1793-94) [49]
De interitu operum cum antiquae tum serioris artis quae Constantinopoli fuisse memorantur, caussae et tempora. Commentatio posterior (1793-94) [50]
Artes ex Constantinopoli nunquam prorsus exulantes usque ad instauratas in occidente artium officinas (1795-98) [51]
De antiqua Homeri lectione indaganda, dividicanda et restituenda (1795-98) [52]
Historiae scribendae inter Graecos primordia (1798-99) [53]
Pietas Societatis Regiae Scientiarum Gottingensis in Burcardi Christiani de Behr dynastae de Stelchte ... viri illustrissimi integerrimi optimi Georgiae Augustae curatoris societatis sodalis honorarii luctuoso [69]